蒸餾器的蒸餾效率是很重要的一項性能，蒸餾效率一方面決定著工作效率，另一方面也體現了一款產品的質量好壞。為確保理想的蒸餾效率、冷卻介質一般建議同加熱鍋溫度保持40℃左右的溫差，以便將熱蒸汽進行快速冷凝，從而降低蒸汽對系統真空的影響。
 

　　蒸餾器加熱鍋溫度越高、溶劑的蒸餾效果越快，但考慮到操作的安全性和目標成分的熱敏性，常用的溫度是60℃再者80℃以上，然而硅油介質難于清潔，一般我們建議顧客通過降低真空值來達到更快的蒸餾效率。
 

　　蒸餾器的密閉空間組成部分如下：蒸發瓶、蒸發管、密封圈、冷凝管、真空緩沖瓶、真空泵、真空管路，其中影響系統真空關鍵的因素是真空泵、密封圈和真空管。一般來說真空泵極限越低系統的真空值也越低。
 

　　所以在蒸餾的時候需要通過真空控制器設置合理的真空值來蒸餾效率同時避免爆沸。循環水泵的極限真空大約為0.095kpa、隔膜真空泵的真空低可達2mbar，但是如果預算允許的話加裝真空控制器或真空閥，它可以控制好蒸餾所需的系統真空值。
 

　　給定系統中的蒸餾速度主要受冷凝器冷凝溶劑蒸汽的能力的限制。如果你讓太多蒸汽沖入冷凝器，它會過載而無法有效工作，這將導致有價值的揮發物損失。為了避免飽和，應該監控系統的壓力，使得2/3的冷凝器始終被冷凝水覆蓋。